Stenocarpella macrospora and Stenocarpella maydis in the cerrado and southern Brazil regions / Stenocarpella macrospora E Stenocarpella maydis nas regiões do cerrado e sul do Brasil

Stenocarpella macrospora and Stenocarpella maydis may result in the seedlings death or cause rotting at the corn stalk base and in all or part of the ear. In addition, S. macrospora can cause leaf spot. Double-haploid strains from corn hybrids resistant to S. macrospora and S. maydis were identified. Also the incidence of these pathogens in the Cerrado and in Southern Brazil localities was determined. One hundred and forty double-haploid maize hybrids, in addition to the controls, were inoculated with S. macrospora and S. maydis and evaluated for resistance reaction in three locations of the Cerrado and three locations of the South regions. The grains attacked by these fungi were collected and variable quantities of S. macrospora, S. maydis and other fungal species were registered. The results demonstrated the prevalence of S. macrospora in the Cerrado as well as other non-Stenocarpella sp. fungi in the South. The city of Abelardo Luz (Santa Catarina) was the only place where S. maydis was found to have a higher incidence than S. macrospora. Environmental effects influence the prevalence of fungi, causing grain rot. These results indicated genetic gains in the selection of hybrids resistant to this fungi for use as direct breeders in Stenocarpella-corn pathological system research.

Stenocarpella macrospora e Stenocarpella maydis em milho, podem resultar na morte de plântulas ou causar apodrecimento na base do caule e da totalidade ou parte da espiga. Além disso, S. macrospora pode causar manchas foliares. Identificou-se linhagens duplo-haplóides de híbridos de milho resistentes a S. macrospora e S. maydis; determinou-se também a incidência desses patógenos no Cerrado e do Sul do Brasil. Cento e quarenta híbridos duplohaplóides de milho além dos controles (testemunhas) foram inoculados com S. macrospora e S. maydis e avaliados quanto à resistência em três localidades do Cerrado e três de Sul do Brasil. Os grãos atacados pelos fungos foram colhidos e avaliados quanto à incidência dos dois patógenos. Foram estimadas as porcentagens (%) de S. Macrospora e de S. Maydis e também a ocorrência de outros fungos pelo método de blotter. Houve maior presença de S. macrospora do Cerrado. No Sul do Brasil, o município de Abelardo Luz foi o único local onde S. maydis foi encontrado em maior incidência do que S. macrospora. Os resultados mostraram efeitos ambientais sobre a prevalência de fungos que causam grãos ardidos. Estes resultados indicaram ganhos genéticos na seleção de híbridos resistentes ao fungo S. Macrospora e obtenção de híbridos resistentes em milho, tanto na região do Cerrado como no Sul do Brasil.

Recursos de bioinformática aplicados às ciências ômicas como genômica, transcriptômica, proteômica, interatômica e metabolômica / Bioinformatic resources applied on the omic sciences as genomic, transcriptomic, proteomic, interatomic and metabolomic

As ciências ômicas tratam da análise global dos sistemas biológicos, integrando diferentes áreas do conhecimento, como a bioquímica, genética, fisiologia e computação, com o objetivo de isolar e caracterizar genes, proteínas e metabólitos, assim como estudar as interações entre eles, com base em técnicas experimentais, softwares e bancos de dados. A bioinformática por sua vez, propõe novas formas de ciência baseada na experimentação in silico, sendo muito dinâmica na sua atualização e fornecendo a base para geração de novos dados e conhecimentos que podem ser aplicados na pesquisa básica e na aplicada com o desenvolvimento de novos produtos e soluções. Este processo está intimamente relacionado à inovação tecnológica, que é conseguida unindo-se a biotecnologia e a bioinformática. Contudo, o objetivo desta revisão é apresentar uma pequena abordagem dos recursos de bioinformática aplicados às ciências ômicas, como genômica, transcriptômica, proteômica, interatômica, metabolômica, farmacogenômica, dentre outras.

The omic sciences had a wide point of view of the biological systems, integrating different knowledgement areas, as biochemistry, genetics and physiology, with the aim of isolation and characterization of genes, proteins and metabolites as well study their interactions, based on experimental techniques, softwares and data banks. Bioinformatics proposes a new science, which is based on in silico experimentation, being very dynamic in its update and also can provides the basis for generation of new data and knowledge that can be applied in basic research and applied to the development of new products and solutions. This process is closely related to technological innovation, which is achieved joining biotechnology and bioinformatics. However, the objective of this review is to present a small approach of bioinformatics resources applied to the omics science, like genomics, transcriptomics, proteomics, interatomics, metabolomics, pharmacogenomics, among others.